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GENEVESTIGATOR®是基因表达的高性能搜索引擎。它集成了上万由专家人工精选、注释的公共芯片和测序的实验结果，将基因在不同的生物环境中，如疾病、药物、组织部位、肿瘤、细胞系或基因型等条件下的表达进行了归一化和可视化，以探索不同生物环境下，基因的表达情况以及基因与生物环境的潜在联系。
通过GENEVESTIGATOR®可以进行什么研究？
♦ 研究不同药物和疾病环境下的基因功能与机制
♦ 优化已有药物靶点和疾病分子标志物Biomarkers
♦ 发掘新药物靶点和疾病分子标志物Biomarkers
♦ 基于数以千计的实验数据更好的阐释自身实验结果
♦ 预测药物副作用，搜寻导致药物靶基因高表达的生物环境
♦ 发掘化合物适用病症，实现药物重定位
♦ 构建基因调节网络，搜寻不同生物环境下的共表达基因
♦ 关联基因与生物环境，包括疾病、药物、组织部位、肿瘤、细胞系和基因型等
♦ 比对大量相似实验，提升自身实验设计
大规模数据，涵盖各个领域，专业化注释分层
公共基因表达谱数据中蕴藏着未被挖掘的宝贵信息，例如基因表达数据库（GEO）和Array Express中收集了大量的基因表达研究数据。通常情况下，实验数据被实验人员自行提交， 这个过程缺乏质量控制和统一管理，可能会产生描述模糊或丢失、样本冗余或错误、数据质量不佳等问题。
GENEVESTIGATOR®从众多公共基因组数据库中收集了超过285,000例来自不同领域、物种、实验的样本数据集。专家团队重新归纳和架构实验结果，通过阅读实验所对应的原文，补充材料，访问网站甚至和作者联系获取数据库中每个样本真实的描述，收录质量合格的数据，对其进行全局归一化，用标准化的语言对实验和样本重新进行描述，解决了大规模公共实验数据无法横向对比的难题。
动物研究和植物研究方向的数据统计
GENEVESTIGATOR®中动物模块中收集了超过250,000例来自不同动物模型的样本数据，植物模块中收集了超过25,000例来自不同的植物与农作物模型的样本数据，以及超过2,000例来自酵母和大肠杆菌的样本数据。在植物学领域，相关引用次数超过3000篇。
研究领域
GENEVESTIGATOR®的研究领域覆盖18个领域，拥有超过500种疾病、数千种药物/化合物治疗研究及毒性研究的数据集。
多样化工具，各角度出发，阐释基因与环境联系
单实验分析工具——针对特定单一实验
♦ 多元可视化特定实验中样本表达量
♦ 按实验设计或自定义差异表达分析
生物环境检索工具——探索影响基因表达的生物环境
♦ 特定基因组在不同组织部位、细胞系与肿瘤条件下的表达情况
♦ 特定基因组在不同扰动条件，如疾病、药物、激素条件下的特异性上下调情况
♦ 特定基因组在生物不同发育阶段的表达情况
基因检索工具——探索特定生物环境下特异性表达的基因
♦ 特定组织部位、细胞系与肿瘤条件下特异性表达的基因组
♦ 特定扰动条件，如疾病、药物、激素条件下特异性上下调的基因组
♦ 特定生物发育阶段特异性表达的基因组
♦ 可做实验内参稳定表达的看家基因组
♦ 特定基因在不同物种中的同源基因
相似性检索工具——探索基因与生物环境的深层联系
♦ 分组聚类具有相似表达图谱的基因或生物环境
♦ 构建不同生物环境下的基因共表达网络
♦ 发掘与药物靶点或疾病分子标志物Biomarkers具有相似性或相反性表达的扰动条件
♦ 发掘在限定生物环境下具有相似表达图谱的基因亚集
♦ 特定基因组的生物功能富集与注释
♦ 可视化不同生物环境下特定的基因对的表达关系
简单的操作，直观的展示，图形化工具
GENEVESTIGATOR®操作简单，执行分析只需点击图片代表的按钮，采用盒形图、散点图、折线图、热图与火山图的形式直观的展示基因表达情况，支持各类算法图形的生成，包括聚类树、基因共表达网络与生物通路Venn图。
直观对比不同组织、细胞系、肿瘤条件下的基因表达情况